Itachi e Kisame aparecem após a invasão da Areia e do Som, e ambos ficam supresos que só Orochimaru tenha feito isso. A missão dele com Hoshigaki Kisame foi de capturar o Jinchuuriki da Kyuubi, Uzumaki Naruto, dentro do vilarejo de Aldeia da folha. Ele se espanta ao ouvir o nome Uchiha Sasuke. Yuuhi Kurenai e Sarutobi Asuma param os dois Akatsukis, e começam a lutar. Facilmente, Itachi lidera a luta,Kisame lutava combatia Asuma e suas Chakras Blades,que eram dominadas pela Samehada de Kisame,Itachi cai em um genjutsu mas logo faz que ele volte contra Kurenai,quando ia a matar estranhamente só faz ela desmaiar com um chute que a lança na água. Quando Kisame iria matar Asuma, Hatake Kakashi aparece imediatamente copia a técnica com seu Sharingan,logo após isso luta com Itachi. Itachi usa seu Tsukuyomi em Hatake Kakashi, que é derrotado facilmente, mas estranhamente Uchiha Itachi não o mata, deixando-o vivo. Maito Gai aparece, e segura Hatake Kakashi. Ele fala para Uchiha Itachi que chamou todo o esquadrão da ANBU para lutar contra ele, e então Uchiha Itachi resolve ir embora com Hoshigaki Kisame, pois não foi lá para começar uma guerra contra o vilarejo de Konoha.
Sasuke está numa caverna e então vê um vulto se aproximando. Ele pergunta quem é. Itachi se revela com um corvo sobre seu braço. Sasuke o encara com seu Sharingan mostrando ódio. Itachi fica supreso por Sasuke ter crescido muito e então tira um sarro dizendo que ele não vai perder o controle desta vez. Sasuke então diz que ele nada sabe sobre ele agora. De repente, Itachi olha para o lado e Sasuke usa seu Chidori Nagashi acertand-o no peito. Sasuke fala que o ódio o tornou mais forte e então Itachi fala que nada sabe sobre isso e então Sasuke despedaça Itachi, este então fala do nada que Sasuke ficou mais forte, assutando Sasuke, mas este revela ser Karasu Bunshin no Jutsu e através desse jutsu fala para Sasuke ira ao esconderijo antigo do clã Uchiha, pois lá eles iram ter seu confronto final.
